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#$Date: 2024-09-20 03:21:42 +0200 (Fri 20 de Sep de 2024) $
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# This file is available in the Crystallography Open Database (COD),
# http://www.crystallography.net/
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# contributors.
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data_7249357
loop_
_publ_author_name
'Garzón-Serrano, Andrea Y.'
'Lozano, Johan D.'
'Perez, Leon D.'
'Sierra, César A.'
'Macías, Mario A.'
_publ_section_title
;
 Zr6O8 core cluster with formula unit
 [Zr6O4(OH)4(OH2)8(CH3COO)4(SO4)4]·nH2O obtained under mild
 conditions
;
_journal_issue                   41
_journal_name_full               'RSC Advances'
_journal_page_first              29910
_journal_page_last               29918
_journal_paper_doi               10.1039/D4RA03940H
_journal_volume                  14
_journal_year                    2024
_chemical_absolute_configuration unk
_chemical_formula_moiety         'C8 H32 O40 S4 Zr6, 13[H2O]'
_chemical_formula_sum            'C8 H58 O53 S4 Zr6'
_chemical_formula_weight         1678.125
_space_group_crystal_system      monoclinic
_space_group_IT_number           9
_space_group_name_Hall           'C -2yc'
_space_group_name_H-M_alt        'C 1 c 1'
_symmetry_Int_Tables_number      9
_audit_creation_date             2024-08-12
_audit_creation_method
;
Olex2 1.5-dev
(compiled 2024.08.07 svn.r83e07e25 for OlexSys, GUI svn.r6697)
;
_audit_update_record
;
2024-08-14 deposited with the CCDC.	2024-09-09 downloaded from the CCDC.
;
_cell_angle_alpha                90
_cell_angle_beta                 116.436(11)
_cell_angle_gamma                90
_cell_formula_units_Z            4
_cell_length_a                   13.9608(13)
_cell_length_b                   27.9958(19)
_cell_length_c                   14.7493(11)
_cell_measurement_reflns_used    3708
_cell_measurement_temperature    298(2)
_cell_measurement_theta_max      75.3770
_cell_measurement_theta_min      4.6130
_cell_volume                     5161.9(9)
_computing_cell_refinement
;
CrysAlisPro, Agilent Technologies,
Version 1.171.37.35 (release 13-08-2014 CrysAlis171 .NET)
(compiled Aug 13 2014,18:06:01)
;
_computing_data_collection
;
CrysAlisPro, Agilent Technologies,
Version 1.171.37.35 (release 13-08-2014 CrysAlis171 .NET)
(compiled Aug 13 2014,18:06:01)
;
_computing_data_reduction
;
CrysAlisPro, Agilent Technologies,
Version 1.171.37.35 (release 13-08-2014 CrysAlis171 .NET)
(compiled Aug 13 2014,18:06:01)
;
_computing_molecular_graphics    'Olex2 1.5-dev (Dolomanov et al., 2009)'
_computing_publication_material  'Olex2 1.5-dev (Dolomanov et al., 2009)'
_computing_structure_refinement  'olex2.refine 1.5-dev (Bourhis et al., 2015)'
_computing_structure_solution    'Superflip (Palatinus & Chapuis, 2007)'
_diffrn_ambient_temperature      298.15
_diffrn_detector_area_resol_mean 10.6144
_diffrn_detector_type            Atlas
_diffrn_measured_fraction_theta_full 0.9979
_diffrn_measured_fraction_theta_max 0.9773
_diffrn_measurement_device       'four-circle diffractometer'
_diffrn_measurement_device_type  'SuperNova, Dual, Cu at zero, Atlas'
_diffrn_measurement_method       'ω scans'
_diffrn_radiation_type           'Cu K\a'
_diffrn_radiation_wavelength     1.54184
_diffrn_reflns_av_R_equivalents  0.0599
_diffrn_reflns_av_unetI/netI     0.0795
_diffrn_reflns_Laue_measured_fraction_full 0.9979
_diffrn_reflns_Laue_measured_fraction_max 0.9773
_diffrn_reflns_limit_h_max       17
_diffrn_reflns_limit_h_min       -11
_diffrn_reflns_limit_k_max       35
_diffrn_reflns_limit_k_min       -30
_diffrn_reflns_limit_l_max       17
_diffrn_reflns_limit_l_min       -18
_diffrn_reflns_number            13189
_diffrn_reflns_point_group_measured_fraction_full 0.6621
_diffrn_reflns_point_group_measured_fraction_max 0.6453
_diffrn_reflns_theta_full        67.6840
_diffrn_reflns_theta_max         76.09
_diffrn_reflns_theta_min         3.87
_exptl_absorpt_coefficient_mu    12.285
_exptl_absorpt_correction_T_max  1.00000
_exptl_absorpt_correction_T_min  0.63737
_exptl_absorpt_correction_type   multi-scan
_exptl_absorpt_process_details
;
CrysAlisPro 1.171.41.119a (Rigaku Oxford Diffraction, 2021)
Empirical absorption correction using spherical harmonics,
implemented in SCALE3 ABSPACK scaling algorithm.
;
_exptl_crystal_colour            colorless
_exptl_crystal_density_diffrn    2.159
_exptl_crystal_description       octahedral
_exptl_crystal_F_000             3350.454
_exptl_crystal_size_max          0.21
_exptl_crystal_size_mid          0.19
_exptl_crystal_size_min          0.18
_platon_squeeze_details          )
_refine_diff_density_max         1.0548
_refine_diff_density_min         -0.9730
_refine_diff_density_rms         0.1436
_refine_ls_abs_structure_details
'Hooft, R.W.W., Straver, L.H., Spek, A.L. (2010). J. Appl. Cryst., 43, 665-668.'
_refine_ls_abs_structure_Flack   0.05(3)
_refine_ls_d_res_high            0.7942
_refine_ls_d_res_low             11.4147
_refine_ls_goodness_of_fit_ref   1.0233
_refine_ls_hydrogen_treatment    mixed
_refine_ls_matrix_type           full
_refine_ls_number_constraints    47
_refine_ls_number_parameters     538
_refine_ls_number_reflns         6972
_refine_ls_number_restraints     103
_refine_ls_restrained_S_all      1.0154
_refine_ls_R_factor_all          0.0632
_refine_ls_R_factor_gt           0.0517
_refine_ls_shift/su_max          -0.0001
_refine_ls_shift/su_mean         0.0000
_refine_ls_structure_factor_coef Fsqd
_refine_ls_weighting_details
'w=1/[σ²(Fo²)+(0.0838P)²] where P=(Fo²+2Fc²)/3'
_refine_ls_weighting_scheme      calc
_refine_ls_wR_factor_gt          0.1315
_refine_ls_wR_factor_ref         0.1437
_reflns_Friedel_coverage         0.312
_reflns_limit_h_max              17
_reflns_limit_h_min              -11
_reflns_limit_k_max              35
_reflns_limit_k_min              -35
_reflns_limit_l_max              17
_reflns_limit_l_min              -18
_reflns_number_gt                5931
_reflns_number_total             6972
_reflns_threshold_expression     I>=2u(I)
_cod_data_source_file            d4ra03940h2.cif
_cod_data_source_block           2023uniandes_cu_05_pca-9_sq
_cod_original_sg_symbol_Hall     ' C -2yc'
_cod_database_code               7249357
_olex2_refinement_description
;
1. Twinned data refinement
 Scales: 0.79(3)
 0.21(3)
2. Fixed Uiso
 At 1.2 times of:
  All O(H) groups
 At 1.5 times of:
  All C(H,H,H) groups, All O(H,H) groups
3. Restrained distances
 O8C-H8Ca = O8C-H8Cb
 0.85 with sigma of 0.02
 H8Ca-H8Cb
 1.34 with sigma of 0.04
 Zr3-H8Ca \\sim Zr3-H8Cb
 with sigma of 0.02
4. Uiso/Uaniso restraints and constraints
Uanis(O16D) \\sim Ueq: with sigma of 0.01 and sigma for terminal atoms of 0.02
5. Rigid body (RIGU) restrains
 O16D, O15D, O13D, S4D, O14D
 with sigma for 1-2 distances of 0.01 and sigma for 1-3 distances of 0.02
 O12D, O11D, O10D, O9D, S3D
 with sigma for 1-2 distances of 0.004 and sigma for 1-3 distances of 0.004
 O4D, O1D, S1D, O2D, O3D
 with sigma for 1-2 distances of 0.004 and sigma for 1-3 distances of 0.004
6.a Rotating group:
 O7C(H7Ca,H7Cb), O6C(H6Ca,H6Cb), O5C(H5Ca,H5Cb), O4C(H4Ca,H4Cb), O2C(H2Ca,
 H2Cb), O3C(H3Ca,H3Cb), O1C(H1Ca,H1Cb)
6.b Ternary CH refined with riding coordinates:
 O1A(H1A), O2A(H2A), O4A(H4A), O3A(H3A)
6.c Me refined with riding coordinates:
 C8E(H8Ea,H8Eb,H8Ec), C6E(H6Ea,H6Eb,H6Ec), C4E(H4Ea,H4Eb,H4Ec)
6.d Idealised Me refined as rotating group:
 C2E(H2Ea,H2Eb,H2Ec)
;
_smtbx_masks_special_details
;
A solvent mask was calculated and 534 electrons were 
found in a volume of 1917Å³ in 1 void per unit cell. 
This is consistent with the presence of 13[H2O] per Formula Unit 
which account for 520 electrons per unit cell.
;
_platon_squeeze_void_probe_radius 1.20
_olex2_submission_special_instructions 'No special instructions were received'
loop_
_space_group_symop_id
_space_group_symop_operation_xyz
1 x,y,z
2 x,-y,z+1/2
3 x+1/2,y+1/2,z
4 x+1/2,-y+1/2,z+1/2
loop_
_atom_site_label
_atom_site_type_symbol
_atom_site_fract_x
_atom_site_fract_y
_atom_site_fract_z
_atom_site_U_iso_or_equiv
_atom_site_adp_type
_atom_site_occupancy
_atom_site_refinement_flags_posn
_atom_site_refinement_flags_adp
Zr1 Zr 0.06637(9) 0.53712(3) 0.43691(7) 0.0301(2) Uani 1.000000 . .
O16D O 0.2331(17) 0.5083(5) 0.7716(11) 0.092(5) Uani 1.000000 . U
O15D O 0.3503(16) 0.5333(7) 0.7023(16) 0.105(6) Uani 1.000000 . U
O14D O 0.2160(9) 0.5862(3) 0.6954(7) 0.041(2) Uani 1.000000 . U
O13D O 0.1742(8) 0.5136(3) 0.5933(6) 0.042(2) Uani 1.000000 . U
O12D O -0.0900(12) 0.4473(4) 0.1517(9) 0.064(3) Uani 1.000000 . U
O11D O -0.2065(12) 0.4906(5) 0.1988(12) 0.074(3) Uani 1.000000 . U
O10D O -0.0210(11) 0.4866(3) 0.3109(7) 0.053(3) Uani 1.000000 . U
O9D O -0.0833(10) 0.5340(3) 0.1578(7) 0.045(2) Uani 1.000000 . U
O8E O 0.3265(8) 0.6501(4) 0.6485(8) 0.040(2) Uani 1.000000 . .
C8E C 0.5080(16) 0.6443(8) 0.6828(15) 0.068(6) Uani 1.000000 . .
H8Ea H 0.5156(16) 0.6494(8) 0.7501(15) 0.102(8) Uiso 1.000000 R .
H8Eb H 0.5448(16) 0.6155(8) 0.6815(15) 0.102(8) Uiso 1.000000 R .
H8Ec H 0.5381(16) 0.6708(8) 0.6632(15) 0.102(8) Uiso 1.000000 R .
O8D O -0.1648(8) 0.7394(4) 0.0181(7) 0.042(2) Uani 1.000000 . .
O8C O 0.1440(9) 0.7642(4) 0.3376(7) 0.046(2) Uani 1.000000 D .
H8Ca H 0.204(5) 0.751(2) 0.352(13) 0.069(4) Uiso 1.000000 DR .
H8Cb H 0.163(11) 0.787(3) 0.380(9) 0.069(4) Uiso 1.000000 DR .
O7E O 0.3704(7) 0.6328(4) 0.5199(7) 0.038(2) Uani 1.000000 . .
C7E C 0.4015(12) 0.6401(5) 0.6168(10) 0.039(3) Uani 1.000000 . .
O7D O 0.0119(9) 0.7095(4) 0.0658(9) 0.048(2) Uani 1.000000 . .
O7C O -0.0988(8) 0.7676(4) 0.3267(7) 0.045(2) Uani 1.000000 . .
H7Ca H -0.155(5) 0.7539(9) 0.322(13) 0.068(3) Uiso 1.000000 GR .
H7Cb H -0.117(9) 0.779(4) 0.268(5) 0.068(3) Uiso 1.000000 GR .
O6E O 0.2027(9) 0.6144(5) 0.2183(7) 0.047(3) Uani 1.000000 . .
C6E C 0.1409(15) 0.6165(6) 0.0418(12) 0.053(4) Uani 1.000000 . .
H6Ea H 0.2148(15) 0.6243(6) 0.0632(12) 0.079(6) Uiso 1.000000 R .
H6Eb H 0.1234(15) 0.5879(6) 0.0017(12) 0.079(6) Uiso 1.000000 R .
H6Ec H 0.0968(15) 0.6423(6) 0.0022(12) 0.079(6) Uiso 1.000000 R .
O6D O -0.1175(7) 0.6640(3) 0.0978(7) 0.0330(18) Uani 1.000000 . .
O6C O -0.2375(9) 0.6841(4) 0.3946(8) 0.046(2) Uani 1.000000 . .
H6Ca H -0.229(4) 0.709(3) 0.430(7) 0.069(4) Uiso 1.000000 GR .
H6Cb H -0.302(4) 0.686(3) 0.348(7) 0.069(4) Uiso 1.000000 GR .
O5E O 0.0291(8) 0.5982(3) 0.1197(7) 0.037(2) Uani 1.000000 . .
C5E C 0.1217(14) 0.6088(5) 0.1331(11) 0.043(3) Uani 1.000000 . .
O5D O -0.0436(9) 0.7357(4) 0.1932(6) 0.043(2) Uani 1.000000 . .
O5C O -0.2074(8) 0.5753(4) 0.4595(8) 0.043(2) Uani 1.000000 . .
H5Ca H -0.254(9) 0.562(4) 0.4063(13) 0.065(3) Uiso 1.000000 GR .
H5Cb H -0.244(10) 0.5898(6) 0.484(11) 0.065(3) Uiso 1.000000 GR .
O4E O -0.2263(8) 0.5997(4) 0.1495(7) 0.041(2) Uani 1.000000 . .
C4E C -0.4061(15) 0.5858(11) 0.1232(14) 0.087(9) Uani 1.000000 . .
H4Ea H -0.4152(15) 0.5798(11) 0.0557(14) 0.130(13) Uiso 1.000000 R .
H4Eb H -0.4274(15) 0.5582(11) 0.1481(14) 0.130(13) Uiso 1.000000 R .
H4Ec H -0.4496(15) 0.6126(11) 0.1223(14) 0.130(13) Uiso 1.000000 R .
O4D O 0.1833(8) 0.8026(4) 0.6462(8) 0.042(2) Uani 1.000000 . U
S4D S 0.2348(4) 0.53509(13) 0.6944(3) 0.0537(10) Uani 1.000000 . U
O4C O -0.0330(8) 0.4890(4) 0.4808(7) 0.041(2) Uani 1.000000 . .
H4Ca H 0.005(3) 0.477(4) 0.539(5) 0.061(3) Uiso 1.000000 GR .
H4Cb H -0.081(7) 0.5050(9) 0.488(11) 0.061(3) Uiso 1.000000 GR .
O4B O 0.0126(7) 0.6707(3) 0.4660(6) 0.0315(17) Uani 1.000000 . .
O1A O 0.0197(7) 0.5856(3) 0.5321(6) 0.0336(18) Uani 1.000000 . .
H1A H 0.0104(7) 0.5729(3) 0.5777(6) 0.040(2) Uiso 1.000000 R .
O2A O -0.1140(7) 0.6677(3) 0.2863(6) 0.0313(17) Uani 1.000000 . .
H2A H -0.1694(7) 0.6812(3) 0.2478(6) 0.038(2) Uiso 1.000000 R .
O1D O 0.1880(8) 0.7173(3) 0.6367(7) 0.0363(18) Uani 1.000000 . U
S1D S 0.1201(2) 0.76150(10) 0.5980(2) 0.0337(6) Uani 1.000000 . U
O1C O 0.3111(9) 0.6805(4) 0.3494(8) 0.045(2) Uani 1.000000 . .
O1B O 0.1737(9) 0.5948(3) 0.4832(6) 0.038(2) Uani 1.000000 . .
Zr2 Zr -0.05358(8) 0.60754(3) 0.21510(7) 0.0290(2) Uani 1.000000 . .
O4A O 0.1012(7) 0.5643(3) 0.3106(6) 0.0318(17) Uani 1.000000 . .
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O3B Zr1 Zr6 31.1(2) . . y
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Zr5 O1B Zr4 115.7(4) . . ?
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O4E Zr2 Zr1 109.3(3) . . y
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O4E Zr2 O6D 75.1(4) . . y
O4E Zr2 O5E 119.9(4) . . y
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O4A Zr2 O6D 141.9(3) . . y
O4A Zr2 O5E 73.4(3) . . y
O4A Zr2 O4E 139.9(3) . . y
O4A Zr2 O2A 121.9(3) . . y
Zr3 Zr2 Zr1 91.24(3) . . y
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O3B Zr2 O5E 142.4(4) . . y
O3B Zr2 O4E 83.7(4) . . y
O3B Zr2 O2A 70.6(3) . . y
O3B Zr2 O4A 70.4(3) . . y
O3B Zr2 Zr3 83.0(3) . . y
O3B Zr2 Zr5 82.8(2) . . y
O3B Zr2 Zr6 31.8(2) . . y
O3B Zr2 O2B 93.8(3) . . y
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O2A Zr3 O4B 69.2(3) . . y
Zr2 Zr3 O8C 121.3(3) . . y
Zr2 Zr3 O7C 115.2(3) . . y
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O3A Zr3 O8C 76.8(4) . . y
O3A Zr3 O7C 148.1(3) . . y
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O3A Zr3 O2A 122.9(3) . . y
O3A Zr3 Zr2 94.7(2) . . y
Zr4 Zr3 O8C 113.3(3) . . y
Zr4 Zr3 O7C 125.3(3) . . y
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Zr6 Zr3 O2A 38.1(2) . . y
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Zr6 Zr3 O3A 96.0(2) . . y
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Zr6 Zr3 Zr5 89.59(3) . . y
O2B Zr3 O8C 94.8(4) . . y
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O2B Zr3 Zr6 83.7(2) . . y
O2D Zr3 O8C 72.5(4) . . y
O2D Zr3 O7C 72.1(4) . . y
O2D Zr3 O5D 124.1(3) . . y
O2D Zr3 O4B 80.4(3) . . y
O2D Zr3 O2A 133.2(4) . . y
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O8E Zr4 O14D 74.1(4) . . y
O4B Zr4 Zr1 83.2(2) . . y
O4B Zr4 O14D 143.4(4) . . y
O4B Zr4 O8E 142.3(3) . . y
O1A Zr4 Zr1 38.6(2) . . y
O1A Zr4 O14D 74.1(4) . . y
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O1A Zr4 O4B 71.0(3) . . y
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O1D Zr4 O14D 116.2(4) . . y
O1D Zr4 O8E 74.1(4) . . y
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O1D Zr4 O1A 141.6(3) . . y
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O1B Zr4 O14D 85.9(3) . . y
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O1E Zr4 Zr3 111.2(2) . . y
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O1B Zr5 Zr1 31.3(2) . . y
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O3B Zr6 Zr2 32.0(2) . . y
O3B Zr6 Zr3 82.9(3) . . y
O3B Zr6 Zr4 82.0(2) . . y
O3B Zr6 O2E 143.3(4) . . y
O3B Zr6 O3E 78.7(4) . . y
C1E O1E Zr4 134.1(8) . . ?
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Zr5 O2B Zr3 117.1(4) . . ?
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Zr6 O3B Zr2 116.2(4) . . ?
loop_
_geom_bond_atom_site_label_1
_geom_bond_atom_site_label_2
_geom_bond_distance
_geom_bond_site_symmetry_2
_geom_bond_publ_flag
Zr1 O13D 2.220(9) . y
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O14D Zr4 2.207(9) . y
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O9D Zr2 2.194(9) . y
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O4B Zr3 2.092(8) . y
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O1D S1D 1.509(10) . ?
O1D Zr4 2.209(9) . y
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S1D O3D 1.474(10) . ?
O1C Zr5 2.218(10) . y
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Zr3 O2D 2.247(9) . y
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Zr4 O1E 2.183(9) . y
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O1E C1E 1.31(2) . ?
C1E O2E 1.269(19) . ?
C1E C2E 1.466(19) . ?
O3E C3E 1.261(17) . ?
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
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_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
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_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
O8C H8Ca O1C 0.86(2) 2.48(6) 3.256(17) 150(10) .
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O7C H7Cb O8E 0.8550 2.53(5) 3.298(15) 150(9) 4_464
O7C H7Cb O1D 0.8550 2.54(11) 3.077(14) 122(10) 4_464
C6E H6Ec O7D 0.9600 2.611(18) 3.273(19) 126.4(4) .
O4C H4Ca O5E 0.8503 2.37(7) 3.053(13) 137(9) 2_565
O4C H4Cb O12D 0.8502 2.81(11) 3.457(16) 134(12) 2_565
O4C H4Cb O5C 0.8502 2.55(3) 3.344(15) 156(5) .
O1A H1A O12D 0.8200 2.200(17) 2.952(17) 152.5(4) 2_565
O2A H2A O4D 0.8200 1.985(13) 2.787(13) 165.7(4) 4_464
O4A H4A O16D 0.8200 2.22(2) 2.967(19) 151.1(5) 2_564
O3A H3A O8D 0.8200 1.981(13) 2.785(13) 166.9(4) 4_565
O1C H1Cb O8D 0.8500 2.72(14) 3.253(14) 122(13) 4_565
loop_
_platon_squeeze_void_nr
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_platon_squeeze_void_average_z
_platon_squeeze_void_volume
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_platon_squeeze_void_content
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loop_
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_restr_distance_site_symmetry_2
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_restr_distance_target_weight_param
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loop_
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_restr_equal_distance_site_symmetry_2
_restr_equal_distance_class_id
Zr3 H8Ca 1 1
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_restr_equal_distance_class_class_id
_restr_equal_distance_class_target_weight_param
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loop_
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_smtbx_masks_void_content
1 -0.578 -0.582 -0.960 1917.0 534.2 '52 H2O'
loop_
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_platon_missing_refln_theta
0 2 0 3.157
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